艾克斯-马赛大学的历史可追溯至1409年由普罗旺斯伯爵路易二世建立的艾克斯大学。1968年"五月革命"后，法国公立大学体系改革，后分别发展成为以文学、艺术和人文科学为主的普罗旺斯大学(艾克斯-马赛第一大学)、以技术医学、理工为主的地中海大学(艾克斯-马赛第二大学)和以经济管理、法律为核心的保罗-塞尚大学(艾克斯-马赛第三大学)。

三所大学自2007年起寻求合并，最终于2012年1月1日起协议生效，成立新的艾克斯-马赛大学。

马赛大学有五个主要校区，现在是法国规模最大的大学，也是法语国家和地区最大的大学。三校合并后，艾克斯-马赛大学成为萨科齐政府领导下建设"超级大学"计划中的一员，每年获得法国政府7.5亿欧元的拨款，是法国公立大学体系里获得教育经费最多的大学。马赛大学拥有数百个研究和教学合作伙伴关系，包括法国高等社会科学研究学院(EHESS)和国家科学研究中心(CNRS)。马赛大学是欧洲大学协会(EUA)和地中海大学联盟(UNIMED)成员。

本科/硕士/博士：法学、工学、管理学、教育学、经济学、理学、历史学、文学、医学、哲学、艺术学

MBA：管理学

马赛大学在艺术、文学、科学，法律，政治，商业，经济等领域已经产生了许多出名的校友。迄今为止，教职员工中出现了5位诺贝尔奖获得者，2位获得普利策奖的获奖者，4名塞萨尔奖获得者，数位国家元首或政府首脑，议会议长，政府部长，大使和法兰西学院院士。